Thomas rossz fát tett a tűzre, ezért a megszokott útvonala helyett egy új szárnyvonalra küldik dolgozni. Eleinte semmi kedve elhagyni a kellemes kis szakaszát, ám ami ezen a vágányon történik, az mindenért kárpótolja. Figyelmetlensége miatt beszakad az építkezésnél a talaj, a keletkezett üregben pedig valami elképesztőt talál. Egy rég elfeledett kalózhajóra bukkan!
Sodor sziget minden lakója csodájára jár és egyesek azt kezdik rebesgetik, hogy az Elveszett Kalóz szelleme kísért emiatt a környéken, hogy megtalálja a kincsét. Thomas nagyon izgatott lesz a hír hallatán, és mikor épp jobban bele akarja ásni magát a történtekbe, két különös alakkal fut össze a szigeten.
De vajon kik ők? És mit keresnek a szigeten? Vajon közük van a szellemhez, amit egyesek látni vélnek?